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       lnRNA/轉錄組測序

      lnRNA/轉錄組測序


      轉錄組測序

      轉錄組測序是基于HiSeq平臺,對待特定組織或者細胞在某個時期轉錄出來的所有mRNA進行測序,即可研究已知基因,亦能發掘新基因,全面快速地獲得mRNA序列和風度信息。


      案例分析

      案 例 通過RNAseq技術全面解析乳腺癌組織中的可變剪切形式

      乳腺癌組織由特定形式的轉錄本發揮特殊功能,本研究應用RNAseq技術獲得了三種典型乳腺癌組織TNBC、non-TNBC和HER2陽性乳腺癌的轉錄本信息。該研究發現了新可變剪切形式和可變剪切后的新轉錄本,進一步研究發現,乳腺癌組織與正常乳腺組織在轉錄本表達水平和啟動子轉移水平存在顯著差異,并RT-PCR驗證CDK4,LARP1 , ADD3和PHLPP2等轉錄本形式。該研究第一次系統研究了不同亞型乳腺癌組織轉錄本利用可變剪切形式和轉錄本特異表達的情況。

       


      長鏈非編碼RNA測序

      長鏈非編碼RNAlong noncoding RNA, lncRNA)是一類長度超過200 nt的長鏈非編碼RNA,通過與DNARNA或蛋白質結合,在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等水平調控基因表達。
      測序采用Illumina HiSeq平臺進行測序,針對有參考基因組樣本開展準確的lncRNA鑒定
      lncRNA靶基因預測,同時提供針對測序數據中mRNA的分析,結果更全面,廣泛應用于醫學、農學研究領域。

      長鏈非編碼RNA測序的特點:

      LncRNA的研究作為RNA研究的新領域,在生產、生活、健康方面具有重要意義,可通過不同的分子生物學機制調控編碼基因的表達,在生產上對物種的改良,在人類健康方面參與疾病相關的信號通路從而對疾病的發生發展及治療有重要作用。長鏈非編碼RNA測序操作步驟:

      1、研究對象的選取;

      2、提取RNA,RNA量≥2.0ug;

      3、鏈特異性文庫的構建;

      4、PE150測序(12-24Gb);

      5、信息分析,利用六步法對lncRNA進行準確篩選,高效預測靶基因,并完成對轉錄本中mRNA的分析,以及lncRNA和mRNA的比較分析、共表達網絡構建。

      四、客戶提供目的樣本:

      如動物組織、細胞等以及相關的樣本信息,需要干冰運輸

      五、服務周期:

      65天


      威斯騰實驗服務流程



      威斯騰生物服務項目

      分子生物學檢測蛋白質與免疫學動物實驗
      實時熒光定量PCR單克隆抗體制備帕金森疾病模型
      免疫共沉淀(Co-IP多克隆抗體制備抑郁癥動物模型
      ELISA(酶聯免疫吸附法)技術Western-blot 實驗服務脊髓損傷模型
      生化指標檢測蛋白雙向電泳實驗服務腦外損傷模型
      雙熒光素酶報告基因檢測原核蛋白表達純化骨神經損傷模型
      染色質免疫共沉淀(ChIP真核蛋白表達純化心肌缺血模型
      GST pull DownITRAQ定量蛋白質組學心力衰竭模型
      SLAC蛋白組學肺動脈高血壓動物模型
      高血壓模型
      病毒包裝實驗課題整體外包粥樣動脈硬化模型
      過表達/干擾慢病毒包裝純化整體課題外包大腦中動脈阻塞模型
      過表達/干擾腺病毒包裝純化細胞整體實驗外包慢性之氣管炎模型
      逆轉錄病毒包裝純化動物整體實驗外包過敏性哮喘模型
      腺相關病毒包裝純化肺炎大鼠模型
      肝炎-肝硬化-肝癌模型
      蛋白芯片原代細胞培養肝纖維化模型
      細胞因子芯片骨髓間充質干細胞培養膽結石模型
      BioPlex懸浮芯片脂肪干細胞培養急性胰腺炎模型
      生長因子芯片心肌成纖維細胞培養急性腎衰竭模型
      炎癥因子芯片軟骨細胞培養體內血栓模型
      血管生成因子芯片血管內皮細胞培養關節炎模型
      凋亡因子芯片神經元細胞培養I型和II型糖尿病模型
      趨化因子芯片內皮組細胞原代培養裸鼠成瘤
      HuProt TM 20K人類蛋白組芯片基因編輯動物
      電生理相關服務動物整體實驗服務
      膜片鉗實驗
      細胞生物學檢測高通量測序代謝組學
      細胞原代培養mRNA測序氣相色譜GC/MS
      MTT檢測LncRNA測序液相色譜LC/MS
      細胞凋亡檢測全基因組測序核磁共震NMR
      細胞周期檢測RNA-Seq測序
      細胞克隆形成實驗外顯子測序影像學相關實驗
      Transwell細胞遷移/侵襲16s擴增子測序Micro-CT
      流式分選Small RNA測序小動物活體成像
      CCK8/XTT檢測宏基因組測序核磁共振
      臺盼藍檢測細胞活性單細胞測序PET-CT
      藥物篩選細胞學實驗circleRNA測序
      細胞粘附性檢測甲基化測序基因編輯動物
      細胞劃痕實驗條件性敲除小鼠/大鼠
      細胞生物學整體實驗全基因敲除小鼠/大鼠
      細胞成管實驗
      病理檢測CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入基因芯片
      掃描電鏡基因定點突變細胞系LncRNA芯片
      透射電鏡單基因敲除細胞系miRNA芯片
      HE染色多基因敲除細胞系mRNA芯片
      免疫組化目的基因敲入細胞系甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
      Tunel(原位末端凋亡法)檢測報告基因敲入細胞系SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
      激光共聚焦miRNA/LncRNA敲除細胞系
      免疫熒光
      Masson染色CRISPR/Cas9動物敲除/敲入科研設計指導&文章評估/潤色
      原位雜交基因敲除大鼠/小鼠科研文獻論著翻譯
      熒光原位雜交基因敲入大鼠/小鼠論文翻譯潤色服務
      特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)臨床實驗/科研實驗設計方案指導
      行為學檢測藥物篩選服務項目藥效學評價
      曠場實驗高通量自動藥物篩選平臺抗腫瘤藥物藥效學評價
      重復性刻板行為檢測細胞高內涵藥物篩選平臺心血管系統藥物藥效學評價
      動物跑臺檢測蛋白質組學靶標研發平臺泌尿系統藥物藥效學評價
      強迫游泳分子藥理研究平臺內分泌系統藥物藥效學評價
      生物膜片鉗藥物篩選平臺抗炎免疫藥物藥效學評價
      常規藥物體外篩選

        

      【本平臺合作項目】
      分子生物學、細胞生物學、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學檢測、免疫學檢測、影像學檢測、原代培養、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學、代謝組學、高通量高內涵篩選、藥效學評價、藥理毒理學實驗、慢病毒包裝與穩轉株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學分析、知識產權服務! 
      【全國免費熱線】400-675-6758
      【電話】 023-65316016,023-65316556
      【郵箱】 china-western@163.com
      【官網網址】www.5002688.com
      【地址】 重慶市高新區二郎創業大道高科創業園D棟2樓   

       

       

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