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       ChIP-seq/circRNA測序

      ChIP-seq/circRNA測序

      ChIP-seq測序

      ChIP-seq采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后,分離與其結合的基因組DNA片段,并通過高通量測序,在全基因組范圍內尋找目的蛋白特異結合的DNA位點,且可基于多個樣品進行差異比較分析及特異蛋白結合位點的序列偏好性分析。

      ChIP-seq優勢:

      用于在全基因組范圍中研究蛋白特異結合的DNA片段,組蛋白修飾和表觀遺傳修飾的技術,研究這三個主題有助于洞悉蛋白對基因表達的調控以及染色體的功能結構。具有“覆蓋全,周期快,分析科學”的優勢,已廣泛應用于人、小鼠、酵母、水稻、擬南芥等物種的研究。

      ChIP-seq操作步驟:

      1、研究對象的選取;

      2、提取DNA樣本,DNA量≥20ng;

      3、ChIP-seq文庫構建;

      4、PE150測序(10-20Mb);

      5、信息分析,通過對IP下來的合格DNA樣本,建庫測序,獲得高質量reads,根據SCC曲線判斷IP效果,通過motif分析判斷IP的特異性以及分析的可信性,高效預測相關基因,進行功能富集分析、預測特異蛋白的功能,組蛋白染色體結合圖譜以及DNA的表觀修飾。

      服務周期:

      50天

      案例分析

      案例:雌***受體結合異常與乳腺癌臨床試驗的相關性研究
      雌***受體(ER)可與相關基因結合形成復合體并移位到細胞核結合下游基因激活它們轉錄,為腫瘤生長助力。在許多乳腺患者體內,就是因為該受體影響了基因的功能,從而引發致癌連鎖反應。現在常用的***等乳腺癌治療藥物,就是通過阻斷雌***受體對基因的作用而發揮效果。但在不少患者身上,這種藥物的效果并不理想。本研究基于高通量平臺的染色質免疫共沉淀技術ChIP-seq全基因組范圍內尋找ER結合位點,從而鑒定雌***結合模式是否在患者腫瘤中存在差異。 


      circRNA測序

      環狀 RNA(circRNA)是一類特殊的 RNA 分子,也是 RNA 領域的研究熱點。與傳統的線性 RNA(linear RNA,含 5’和 3’末端)不同,circRNA 分子呈封閉環狀結構,不受 RNA 外切酶影響,表達更穩定,不易降解。近幾年的研究表明,circRNA 在生物的生長發育、疾病的發生發展、對外界環境的抵御等方面具有重要的調控作用。由于 circRNA 的閉合環狀特性,通過去除 total RNA 中的 rRNA 和線性 RNA 分子,可以特異地富集 circRNA 分子后測序,更有針對性地分析受檢樣本中特定的 circRNA 譜、circRNA 剪接模式、組間差異和分子功能等。

      服務特色

      • 應用范圍廣:可以檢測幾乎任何動植物的 circRNA
      • 環狀 RNA 全覆蓋:高深度覆蓋,可以檢測到低豐度的 circRNA
      • 生物信息學分析:強大的生物信息學團隊,提供circRNA 鑒定、circRNA 功能預測、circRNA 分子標志物篩選等深入分析易讀性強的數據報告

      推薦測序模式

      • Hiseq X Ten,PE150   
      • 推薦10 Gb/樣本



      威斯騰實驗服務流程



      威斯騰生物服務項目

      分子生物學檢測蛋白質與免疫學動物實驗
      實時熒光定量PCR單克隆抗體制備帕金森疾病模型
      免疫共沉淀(Co-IP多克隆抗體制備抑郁癥動物模型
      ELISA(酶聯免疫吸附法)技術Western-blot 實驗服務脊髓損傷模型
      生化指標檢測蛋白雙向電泳實驗服務腦外損傷模型
      雙熒光素酶報告基因檢測原核蛋白表達純化骨神經損傷模型
      染色質免疫共沉淀(ChIP真核蛋白表達純化心肌缺血模型
      GST pull DownITRAQ定量蛋白質組學心力衰竭模型
      SLAC蛋白組學肺動脈高血壓動物模型
      高血壓模型
      病毒包裝實驗課題整體外包粥樣動脈硬化模型
      過表達/干擾慢病毒包裝純化整體課題外包大腦中動脈阻塞模型
      過表達/干擾腺病毒包裝純化細胞整體實驗外包慢性之氣管炎模型
      逆轉錄病毒包裝純化動物整體實驗外包過敏性哮喘模型
      腺相關病毒包裝純化肺炎大鼠模型
      肝炎-肝硬化-肝癌模型
      蛋白芯片原代細胞培養肝纖維化模型
      細胞因子芯片骨髓間充質干細胞培養膽結石模型
      BioPlex懸浮芯片脂肪干細胞培養急性胰腺炎模型
      生長因子芯片心肌成纖維細胞培養急性腎衰竭模型
      炎癥因子芯片軟骨細胞培養體內血栓模型
      血管生成因子芯片血管內皮細胞培養關節炎模型
      凋亡因子芯片神經元細胞培養I型和II型糖尿病模型
      趨化因子芯片內皮組細胞原代培養裸鼠成瘤
      HuProt TM 20K人類蛋白組芯片基因編輯動物
      電生理相關服務動物整體實驗服務
      膜片鉗實驗
      細胞生物學檢測高通量測序代謝組學
      細胞原代培養mRNA測序氣相色譜GC/MS
      MTT檢測LncRNA測序液相色譜LC/MS
      細胞凋亡檢測全基因組測序核磁共震NMR
      細胞周期檢測RNA-Seq測序
      細胞克隆形成實驗外顯子測序影像學相關實驗
      Transwell細胞遷移/侵襲16s擴增子測序Micro-CT
      流式分選Small RNA測序小動物活體成像
      CCK8/XTT檢測宏基因組測序核磁共振
      臺盼藍檢測細胞活性單細胞測序PET-CT
      藥物篩選細胞學實驗circleRNA測序
      細胞粘附性檢測甲基化測序基因編輯動物
      細胞劃痕實驗條件性敲除小鼠/大鼠
      細胞生物學整體實驗全基因敲除小鼠/大鼠
      細胞成管實驗
      病理檢測CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入基因芯片
      掃描電鏡基因定點突變細胞系LncRNA芯片
      透射電鏡單基因敲除細胞系miRNA芯片
      HE染色多基因敲除細胞系mRNA芯片
      免疫組化目的基因敲入細胞系甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
      Tunel(原位末端凋亡法)檢測報告基因敲入細胞系SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
      激光共聚焦miRNA/LncRNA敲除細胞系
      免疫熒光
      Masson染色CRISPR/Cas9動物敲除/敲入科研設計指導&文章評估/潤色
      原位雜交基因敲除大鼠/小鼠科研文獻論著翻譯
      熒光原位雜交基因敲入大鼠/小鼠論文翻譯潤色服務
      特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)臨床實驗/科研實驗設計方案指導
      行為學檢測藥物篩選服務項目藥效學評價
      曠場實驗高通量自動藥物篩選平臺抗腫瘤藥物藥效學評價
      重復性刻板行為檢測細胞高內涵藥物篩選平臺心血管系統藥物藥效學評價
      動物跑臺檢測蛋白質組學靶標研發平臺泌尿系統藥物藥效學評價
      強迫游泳分子藥理研究平臺內分泌系統藥物藥效學評價
      生物膜片鉗藥物篩選平臺抗炎免疫藥物藥效學評價
      常規藥物體外篩選


      【本平臺合作項目】
      分子生物學、細胞生物學、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學檢測、免疫學檢測、影像學檢測、原代培養、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學、代謝組學、高通量高內涵篩選、藥效學評價、藥理毒理學實驗、慢病毒包裝與穩轉株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學分析、知識產權服務! 
      【全國免費熱線】400-675-6758
      【電話】 023-65316016,023-65316556
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