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       lncRNA芯片

      lncRNA芯片

      一、lncRNA芯片

      長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是長度在200-100000 nt之間的RNA分子,它們不編碼蛋白,但參與細胞內多種過程調控。人們對lncRNA的認識還處在初級階段,lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質修飾、轉錄激活、轉錄干擾、核內運輸等多種重要的調控過程,與人類疾病的發生、發展和防治都有著密切的關系。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生的轉錄本是lncRNA(相應的蛋白編碼RNA的比例是1%-5%)。lncRNA已經成為非編碼RNA研究領域的一個熱點。
      lncRNA研究的重要一步是發現與特定疾病相關的lncRNA。傳統的lncRNA篩選方法(SELEX等)效率低下,假陽性率高。而基因芯片具有覆蓋全面、高效、準確的特點,因此用基因芯片來篩選lncRNA是一種準確快捷的方法。

      二、lncRNA技術特點:
      1)目前市面上探針密度最高的lncRNA芯片產品;
      2)芯片采用Agilent eArray平臺設計,使用Agilent SurePrint技術合成,技術重復性高于99%;
      3)覆蓋主流數據庫所有lncRNA,可同時檢測lncRNA和mRNA,并挖掘兩者之間的關聯;
      4)檢出率高:隨機引物擴增方式,可同時擴增帶Ploy-A和不帶Poly-A的lncRNA,確保更多的   lncRNA被檢測出來;
      5)提供完整lncRNA芯片數據分析解決方案。 

      三、lncRNA芯片服務流程:

      1、總RNA提取;

      2、反轉錄合成cDNA;

      3、體外轉錄合成cRNA;

      4、隨機引物合成正義鏈cDNA

      5、DNA片段化,生物素標記;

      6、芯片雜交、洗滌、染色、掃描。

      四、樣本要求:細胞、新鮮組織或總RNA樣品

      1、提取RNA量≥1ug;

      2、細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存。

      3、樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。

      五、應用:

      篩選差異表達的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注釋、lncRNA調控機制預測

      六、服務流程


      七、服務項目


      分子生物學類蛋白質與免疫學動物實驗
      實時熒光定量PCR單克隆抗體制備帕金森疾病模型
      免疫共沉淀(Co-IP)多克隆抗體制備抑郁癥動物模型
      ELISA(酶聯免疫吸附法)技術Western-blot 實驗服務脊髓損傷模型
      生化指標檢測蛋白雙向電泳實驗服務腦外損傷模型
      雙熒光素酶報告基因檢測原核蛋白表達純化骨神經損傷模型
      染色質免疫共沉淀(ChIP)真核蛋白表達純化心肌缺血模型
      GST pull DownITRAQ定量蛋白質組學心力衰竭模型
      SLAC蛋白組學肺動脈高血壓動物模型
      高血壓模型
      病毒類實驗課題整體外包粥樣動脈硬化模型
      過表達/干擾慢病毒包裝純化整體課題外包大腦中動脈阻塞模型
      過表達/干擾腺病毒包裝純化細胞整體實驗外包慢性之氣管炎模型
      逆轉錄病毒包裝純化動物整體實驗外包過敏性哮喘模型
      腺相關病毒包裝純化肺炎大鼠模型
      肝炎-肝硬化-肝癌模型
      蛋白芯片原代細胞培養肝纖維化模型
      細胞因子芯片骨髓間充質干細胞培養膽結石模型
      生長因子芯片脂肪干細胞培養急性胰腺炎模型
      信號通路磷酸化水平檢測芯片心肌成纖維細胞培養急性腎衰竭模型
      BioPlex懸浮芯片軟骨細胞培養體內血栓模型
      生長因子芯片血管內皮細胞培養關節炎模型
      炎癥因子芯片神經元細胞培養I型和II型糖尿病模型
      血管生成因子芯片內皮組細胞原代培養裸鼠成瘤
      凋亡因子芯片基因編輯動物
      趨化因子芯片電生理相關服務動物整體實驗服務
      HuProt TM 20K人類蛋白組芯片膜片鉗實驗
      細胞生物學高通量測序代謝組學
      細胞原代培養mRNA測序氣相色譜GC/MS
      MTT檢測LncRNA測序液相色譜LC/MS
      細胞凋亡檢測全基因組測序核磁共震NMR
      細胞周期檢測RNA-Seq測序
      細胞克隆形成實驗外顯子測序影像學相關實驗
      Transwell細胞遷移/侵襲16s擴增子測序Micro-CT
      流式分選Small RNA測序小動物活體成像
      CCK8/XTT檢測宏基因組測序核磁共振
      臺盼藍檢測細胞活性單細胞測序PET-CT
      藥物篩選細胞學實驗circleRNA測序
      細胞粘附性檢測甲基化測序基因編輯動物
      細胞劃痕實驗條件性敲除小鼠/大鼠
      細胞生物學整體實驗全基因敲除小鼠/大鼠
      細胞成管實驗
      病理類CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入基因芯片
      掃描電鏡基因定點突變細胞系LncRNA芯片
      透射電鏡單基因敲除細胞系miRNA芯片
      HE染色多基因敲除細胞系mRNA芯片
      免疫組化目的基因敲入細胞系甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
      Tunel(原位末端凋亡法)檢測報告基因敲入細胞系SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
      激光共聚焦miRNA/LncRNA敲除細胞系
      免疫熒光
      Masson染色CRISPR/Cas9動物敲除/敲入科研方案設計與SCI相關服務
      原位雜交基因敲除大鼠/小鼠科研文獻論著翻譯
      熒光原位雜交基因敲入大鼠/小鼠SCI論文翻譯潤色服務
      特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)臨床實驗/科研實驗設計方案指導
      行為學檢測藥物篩選服務項目藥效學評價
      水迷宮實驗高通量自動藥物篩選平臺神經系統藥物藥效學評價
      曠場實驗細胞高內涵藥物篩選平臺抗腫瘤藥物藥效學評價
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      動物跑臺檢測分子藥理研究平臺泌尿系統藥物藥效學評價
      強迫游泳生物膜片鉗藥物篩選平臺內分泌系統藥物藥效學評價
      常規藥物體外篩選抗炎免疫藥物藥效學評價

       

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